制冷機組在運轉過程中，風側及水側換熱器會因為灰塵、油污、水垢、雜質等污染而降低傳熱效果，引起功耗增加甚至機組損壞。修理或安裝機組需要管道焊接時，由于氧化作用會使系統內存在氧化物與雜質，這些污物或堵塞過濾器，或進入壓縮機損壞機器。因此，有必要對系統進行除污與除垢操作，以保證機組的正常運行。

管路內壁除污常用的方法有高壓氣體吹除和溶液清洗，有時兩者并用。

吹除常用壓縮空氣或氮氣，小型機組有時也用臨沂制冷劑進行吹除。吹除清污一般分段進行，先吹高壓系統，再吹低壓系統，排污口一般設在系統中設備的最低位置以利于污物的排出。吹除的效果可用下列方法進行檢驗:用一干凈的白紗布放置在排污口處，若白紗布上沒有污染的痕跡，證明系統已經吹除干凈，可以結束吹除工作。

銅管的清洗先用15%~20%的氫氟酸溶液腐蝕3min,除掉彎管內剩余的沙子，再用10%~15%的蘇打水溶液和熱水沖洗，最后在120~150℃溫度下烘干3~4h。毛細管的清洗先用650℃左右的高溫烤去管內油污，待冷卻后用高壓氣體吹凈灰塵，再用四氯化碳沖洗，用氮氣或干燥空氣吹干。