地下水源熱泵系統有兩種類型:開式地下水系統和閉式地下水系統。所謂開式地下水系統就是將地下水通過潛水泵直接供給水一水熱泵機組或多臺并聯連接的熱泵，吸收了房間的熱量(或放出熱量)后排入地表或回灌井中。系統定壓由潛水泵和隔膜式膨脹罐來完成。

在供水管上設置電磁閥或電動閥可以控制供給系統地下水的流量。對于使用開式地下水系統的熱泵或水一水熱泵機組，考慮到腐蝕問題，建議機組換熱器使用銅鎳合金熱交換器(經驗表明，在低溫地下水系統中，存在腐蝕和結垢的可能性)。使用開式地下水熱泵系統時應具備以下幾個條件:地下水水量充足，水質好，具有較高的穩定水位，建筑物高度低(降低潛水泵能量消耗)。在采用開式系統時，應首先進行水質分析。在閉式地下水系統中,使用板式熱交換器把地下水和熱泵機組水系統隔開。系統所用的地下水由單個或多個井提供，經過板式換熱器與熱泵機組的水系統換熱，然后排向地表或者排人地下回灌井。由于地下水不進入熱泵機組，因此避免了機組的腐蝕。